Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PRDM2Q13029 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PRDM2Q13029 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
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