Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP1Q12981 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP1Q12981 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms