Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNH2Q12809 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNH2Q12809 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
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