Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 RPA49YNL248C 1248 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 SAM4YPL273W 978 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 ATG14YBR128C 1035 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 DCC1YCL016C 1143 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 STE50YCL032W 1041 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 YJR015WYJR015W 1533 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 STE13YOR219C 2796 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 ROG3YFR022W 2202 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 HXT5YHR096C 1779 nt4.96□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 ARG4YHR018C 1392 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 YDR222WYDR222W 1248 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 YGR015CYGR015C 987 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 CIR1YGR207C 786 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 HRT3YLR097C 1035 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 CDA2YLR308W 939 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 UGA1YGR019W 1416 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 CLB5YPR120C 1308 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 RGP1YDR137W 1992 nt4.95□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 NOB1YOR056C 1380 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 MOT2YER068W 1764 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 PDC1YLR044C 1692 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 ALG9YNL219C 1668 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 PTC1YDL006W 846 nt4.94□□□□□ -1.62
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TY2A-OR1Q12439 UTR4YEL038W 684 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt4.94□□□□□ -1.62
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TY2A-OR1Q12439 YJR056CYJR056C 711 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 MTW1YAL034W-A 870 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 SFK1YKL051W 1062 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 SED5YLR026C 1023 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 CSR1YLR380W 1227 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 TPP1YMR156C 717 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 YOR024WYOR024W 324 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 PDX3YBR035C 687 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 YPL191CYPL191C 1083 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 MTC1YJL123C 1437 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 YEL077CYEL077C 3834 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 KCH1YJR054W 1494 nt4.94□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 ATG20YDL113C 1923 nt4.93□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 PUS9YDL036C 1389 nt4.93□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 GGA1YDR358W 1674 nt4.93□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 PRD1YCL057W 2139 nt4.93□□□□□ -1.62
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TY2A-OR1Q12439 COS2YBR302C 1140 nt4.93□□□□□ -1.62
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TY2A-OR1Q12439 OXP1YKL215C 3861 nt4.92□□□□□ -1.62
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TY2A-OR1Q12439 PHO12YHR215W 1404 nt4.9□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 PHO11YAR071W 1404 nt4.9□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 ARN2YHL047C 1863 nt4.9□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 VID30YGL227W 2877 nt4.9□□□□□ -1.62
TY2A-OR1Q12439 YDR161WYDR161W 1164 nt4.9□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 YDR336WYDR336W 945 nt4.9□□□□□ -1.63
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TY2A-OR1Q12439 ERI1YPL096C-A 207 nt4.9□□□□□ -1.63
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TY2A-OR1Q12439 VPS68YOL129W 555 nt4.89□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 YOL166CYOL166C 339 nt4.89□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 NGR1YBR212W 2019 nt4.89□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 CAB3YKL088W 1716 nt4.89□□□□□ -1.63
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TY2A-OR1Q12439 POP6YGR030C 477 nt4.88□□□□□ -1.63
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TY2A-OR1Q12439 YBR219CYBR219C 384 nt4.88□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 DAK1YML070W 1755 nt4.88□□□□□ -1.63
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