Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YLR124WYLR124W 345 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 MPD2YOL088C 834 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 PET123YOR158W 957 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 CCL1YPR025C 1182 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 ECM7YLR443W 1347 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 MSC3YLR219W 2187 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SGE1YPR198W 1632 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 PAP2YOL115W 1755 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SLD2YKL108W 1362 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 DOT1YDR440W 1749 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YER134CYER134C 537 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 COX6YHR051W 447 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YJR011CYJR011C 786 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 THI11YJR156C 1023 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 RNP1YLL046C 750 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YLL056CYLL056C 897 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 PUT1YLR142W 1431 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SPS19YNL202W 879 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 UAF30YOR295W 687 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 IME2YJL106W 1938 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 MSY1YPL097W 1479 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 AVT4YNL101W 2142 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YJR061WYJR061W 2808 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 STL1YDR536W 1710 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 snR7-LsnR7-L 214 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 RCR2YDR003W 633 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 RPL22BYFL034C-A 369 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 CIC1YHR052W 1131 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SOL3YHR163W 750 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YKL071WYKL071W 771 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 CDC73YLR418C 1182 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 MRPL19YNL185C 477 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YNL200CYNL200C 741 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 MDJ2YNL328C 441 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 IRC13YOR235W 315 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 CPA1YOR303W 1236 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 NUP49YGL172W 1419 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 ADE13YLR359W 1449 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 COS7YDL248W 1152 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 PPH3YDR075W 927 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YDR157WYDR157W 402 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YER084W-AYER084W-A 513 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 MRPS35YGR165W 1038 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 TDA10YGR205W 873 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 LEU5YHR002W 1074 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 HMS2YJR147W 1077 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 COS5YJR161C 1152 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SWD2YKL018W 990 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 KTI12YKL110C 942 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 GAT3YLR013W 426 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 QRI5YLR204W 336 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SNO4YMR322C 714 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YNL120CYNL120C 486 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 RRG9YNL213C 645 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 snR11snR11 258 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 TUM1YOR251C 915 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 HSP33YOR391C 714 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPL073CYPL073C 486 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 UIP4YPL186C 915 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 HSP32YPL280W 714 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPR172WYPR172W 603 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 LAS1YKR063C 1509 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SPO23YBR250W 1572 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 CCC2YDR270W 3015 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 BUD30YDL151C 582 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YDR056CYDR056C 618 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 DOS2YDR068W 933 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 DON1YDR273W 1098 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 NSA2YER126C 786 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 PRS3YHL011C 963 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 KSH1YNL024C-A 219 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPL113CYPL113C 1191 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPR078CYPR078C 1119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 GAA1YLR088W 1845 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 ZWF1YNL241C 1518 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 ELO2YCR034W 1044 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 GLE2YER107C 1098 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 FMP48YGR052W 1110 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 RER2YBR002C 861 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SGT1YOR057W 1188 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 PLP2YOR281C 861 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 PEP4YPL154C 1218 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPL205CYPL205C 345 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 snR44snR44 211 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YER137C-AYER137C-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YER159C-AYER159C-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 ERG9YHR190W 1335 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YJR026WYJR026W 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
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