Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 PHO8YDR481C 1701 nt4.48□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 TRS85YDR108W 2097 nt4.47□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 GIR2YDR152W 798 nt4.47□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YGR022CYGR022C 330 nt4.47□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 RTT106YNL206C 1368 nt4.47□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 HOYDL227C 1761 nt4.47□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 SBE2YDR351W 2595 nt4.47□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 ORC6YHR118C 1308 nt4.46□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YBR139WYBR139W 1527 nt4.46□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 IFM1YOL023W 2031 nt4.46□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 MKS1YNL076W 1755 nt4.46□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 UGA2YBR006W 1494 nt4.46□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 KIN28YDL108W 921 nt4.46□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 PAU17YLL025W 375 nt4.46□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YMR315WYMR315W 1050 nt4.46□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 DAL82YNL314W 768 nt4.46□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 HUL4YJR036C 2679 nt4.46□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 WTM1YOR230W 1314 nt4.46□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 LAS21YJL062W 2493 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YHR127WYHR127W 732 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 CBF1YJR060W 1056 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 IMD1YAR073W 1212 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YML119WYML119W 1074 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YMR085WYMR085W 1299 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 MDG1YNL173C 1101 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 MRPL22YNL177C 930 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 GSM1YJL103C 1857 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 KCC4YCL024W 3114 nt4.45□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 PRM7YDL039C 2097 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 STB2YMR053C 2553 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 AIR2YDL175C 1035 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YJL068CYJL068C 900 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YKL169CYKL169C 384 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 IMP2YMR035W 534 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 OSW5YMR148W 447 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 RKM2YDR198C 1440 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 SSA2YLL024C 1920 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 CDC15YAR019C 2925 nt4.44□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 MNN1YER001W 2289 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 RAD1YPL022W 3303 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YHR177WYHR177W 1362 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 ALD3YMR169C 1521 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 ALD2YMR170C 1521 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YJR115WYJR115W 510 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 NTR2YKR022C 969 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 RCK2YLR248W 1833 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YPK9YOR291W 4419 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 PMC1YGL006W 3522 nt4.43□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 VID28YIL017C 2766 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 TRM8YDL201W 861 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 BIO2YGR286C 1128 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 HXT4YHR092C 1731 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 MRP17YKL003C 396 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 DCN1YLR128W 810 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 HEM15YOR176W 1182 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 VID30YGL227W 2877 nt4.42□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 RRB1YMR131C 1536 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 CLB4YLR210W 1383 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 PEX30YLR324W 1572 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 MDM30YLR368W 1797 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 PER1YCR044C 1074 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 GCV1YDR019C 1203 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 ARP10YDR106W 855 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 RRT7YLL030C 342 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 RTC5YOR118W 1704 nt4.41□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 YAP1YML007W 1953 nt4.4□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 IZH3YLR023C 1632 nt4.4□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 AVT1YJR001W 1809 nt4.4□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 LAP2YNL045W 2016 nt4.4□□□□□ -1.7
MSH5Q12175 COQ4YDR204W 1008 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 NSG1YHR133C 876 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 FBP1YLR377C 1047 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 TRM10YOL093W 882 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 PDX3YBR035C 687 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 snR3snR3 194 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 GPI18YBR004C 1302 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 PFK1YGR240C 2964 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 SMP1YBR182C 1359 nt4.4□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 ZPR1YGR211W 1461 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 RAM1YDL090C 1296 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 snR7-SsnR7-S 179 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 PGU1YJR153W 1086 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 SHP1YBL058W 1272 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 YPL102CYPL102C 303 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 YCR023CYCR023C 1836 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 TRE1YPL176C 2352 nt4.39□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 LDB17YDL146W 1476 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 MMR1YLR190W 1476 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 VHS3YOR054C 2025 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 PIM1YBL022C 3402 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 CBP4YGR174C 513 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 YNL174WYNL174W 573 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 SYP1YCR030C 2613 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 PDR15YDR406W 4590 nt4.38□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 IBA57YJR122W 1494 nt4.37□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 GMC1YDR506C 1827 nt4.37□□□□□ -1.71
MSH5Q12175 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms