Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBRQ0VD83 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms