Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGEF1BQ0VAM2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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