Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPAL4Q0D2K0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL4Q0D2K0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms