Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms