Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC38A11Q08AI6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms