Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 BUD14YAR014C 2130 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 RHO2YNL090W 579 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 PGA2YNL149C 390 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 RER2YBR002C 861 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 CAM1YPL048W 1248 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 MLC2YPR188C 492 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 VNX1YNL321W 2727 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 IXR1YKL032C 1794 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 TRK2YKR050W 2670 nt5.49□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 DEG1YFL001W 1329 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 Q0255Q0255 1419 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 TED1YIL039W 1422 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 SIA1YOR137C 1869 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 RAD7YJR052W 1698 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 IDP1YDL066W 1287 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 YDL183CYDL183C 963 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 RPS2YGL123W 765 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 DSD1YGL196W 1287 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 CBF1YJR060W 1056 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 MTR2YKL186C 555 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 YAL064WYAL064W 285 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 MID2YLR332W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 YBL036CYBL036C 774 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 AAH1YNL141W 1044 nt5.48□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 QDR3YBR043C 2070 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 DBF4YDR052C 2115 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 PTC1YDL006W 846 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 CLC1YGR167W 702 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 PRP45YAL032C 1140 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 PCD1YLR151C 1023 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 PRE7YBL041W 726 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 YBL077WYBL077W 432 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 ATG29YPL166W 642 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 CLN2YPL256C 1638 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 RPT2YDL007W 1314 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 YHR045WYHR045W 1683 nt5.47□□□□□ -1.53
SGO1Q08490 YER186CYER186C 921 nt5.46□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 URA4YLR420W 1095 nt5.46□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YOR062CYOR062C 807 nt5.46□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 RPL3YOR063W 1164 nt5.46□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 RPN7YPR108W 1290 nt5.46□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 GYP1YOR070C 1914 nt5.46□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 ACS2YLR153C 2052 nt5.46□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 PWP1YLR196W 1731 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 LAS21YJL062W 2493 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 RRG1YDR065W 1098 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YGL218WYGL218W 651 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 RHO3YIL118W 696 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 PRM9YAR031W 897 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YLR317WYLR317W 435 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YAP7YOL028C 738 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 TDA6YPR157W 1404 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 HPF1YOL155C 2904 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 SSK1YLR006C 2139 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 EMP46YLR080W 1335 nt5.45□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 PRR2YDL214C 2100 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YEA4YEL004W 1029 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YEL077CYEL077C 3834 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 SKI6YGR195W 741 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YIL089WYIL089W 618 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 PRS1YKL181W 1284 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 EMG1YLR186W 759 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 CPR6YLR216C 1116 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YLR365WYLR365W 333 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 CSM3YMR048W 954 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 TIF5YPR041W 1218 nt5.44□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 ACC1YNR016C 6702 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 NRD1YNL251C 1728 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 MCX1YBR227C 1563 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 KRE28YDR532C 1158 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 DID4YKL002W 699 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YKR047WYKR047W 306 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 VPS20YMR077C 666 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 NRM1YNR009W 750 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 GAS2YLR343W 1668 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 RIT1YMR283C 1542 nt5.43□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 TUB2YFL037W 1374 nt5.42□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 SMP1YBR182C 1359 nt5.42□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YIL060WYIL060W 435 nt5.42□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 RBD2YPL246C 789 nt5.42□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 PDB1YBR221C 1101 nt5.42□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 PAN5YHR063C 1140 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 CIA2YHR122W 696 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 SFH5YJL145W 885 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 EBP2YKL172W 1284 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YML094C-AYML094C-A 402 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YNL108CYNL108C 813 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 SPS4YOR313C 1017 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 MGR2YPL098C 342 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YPR098CYPR098C 486 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 YAP1YML007W 1953 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 FRE3YOR381W 2136 nt5.41□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 PHO12YHR215W 1404 nt5.4□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 PHO11YAR071W 1404 nt5.4□□□□□ -1.54
SGO1Q08490 AIM6YDL237W 1173 nt5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms