Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB2Q08289 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms