Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms