Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC3A1Q07837 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC3A1Q07837 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms