Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CALD1Q05682 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALD1Q05682 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms