Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKCDQ05655 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKCDQ05655 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms