Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OCA2Q04671 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OCA2Q04671 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms