Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELAQ04206 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELAQ04206 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELAQ04206 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELAQ04206 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELAQ04206 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELAQ04206 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELAQ04206 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELAQ04206 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RELAQ04206 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RELAQ04206 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RELAQ04206 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RELAQ04206 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RELAQ04206 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELAQ04206 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELAQ04206 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELAQ04206 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELAQ04206 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELAQ04206 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELAQ04206 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELAQ04206 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELAQ04206 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELAQ04206 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELAQ04206 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELAQ04206 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms