Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIST1H1AQ02539 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIST1H1AQ02539 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms