Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD4Q01804 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD4Q01804 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms