Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms