Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTBN1Q01082 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms