Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED6P86452 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED6P86452 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms