Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA4P83105 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA4P83105 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms