Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAE1P78406 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAE1P78406 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAE1P78406 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAE1P78406 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAE1P78406 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAE1P78406 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAE1P78406 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAE1P78406 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAE1P78406 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAE1P78406 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAE1P78406 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAE1P78406 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAE1P78406 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms