Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP1P63208 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP1P63208 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP1P63208 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP1P63208 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP1P63208 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP1P63208 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP1P63208 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP1P63208 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP1P63208 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP1P63208 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP1P63208 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP1P63208 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP1P63208 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP1P63208 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP1P63208 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP1P63208 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP1P63208 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP1P63208 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP1P63208 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP1P63208 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP1P63208 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP1P63208 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP1P63208 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms