Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTA2P62736 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTA2P62736 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms