Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-21P61565 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-21P61565 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms