Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR3P61158 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms