Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms