Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCL23P55773 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCL23P55773 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCL23P55773 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL23P55773 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL23P55773 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL23P55773 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL23P55773 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL23P55773 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCL23P55773 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCL23P55773 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL23P55773 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL23P55773 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL23P55773 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL23P55773 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL23P55773 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL23P55773 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL23P55773 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL23P55773 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL23P55773 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL23P55773 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL23P55773 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL23P55773 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL23P55773 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL23P55773 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL23P55773 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL23P55773 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL23P55773 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL23P55773 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL23P55773 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL23P55773 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL23P55773 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL23P55773 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL23P55773 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL23P55773 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL23P55773 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL23P55773 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL23P55773 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL23P55773 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL23P55773 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL23P55773 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL23P55773 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL23P55773 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL23P55773 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL23P55773 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL23P55773 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL23P55773 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL23P55773 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms