Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF10P55107 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF10P55107 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF10P55107 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF10P55107 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF10P55107 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF10P55107 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF10P55107 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF10P55107 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF10P55107 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF10P55107 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF10P55107 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF10P55107 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF10P55107 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF10P55107 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF10P55107 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF10P55107 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF10P55107 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF10P55107 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF10P55107 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF10P55107 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF10P55107 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF10P55107 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF10P55107 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF10P55107 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF10P55107 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF10P55107 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF10P55107 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF10P55107 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF10P55107 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF10P55107 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF10P55107 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF10P55107 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF10P55107 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF10P55107 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF10P55107 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF10P55107 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF10P55107 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF10P55107 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF10P55107 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF10P55107 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF10P55107 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF10P55107 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF10P55107 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF10P55107 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.4 ms