Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms