Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P54278 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P54278 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P54278 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P54278 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P54278 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P54278 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P54278 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P54278 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMS2P54278 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMS2P54278 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMS2P54278 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMS2P54278 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMS2P54278 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMS2P54278 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P54278 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P54278 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P54278 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P54278 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P54278 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMS2P54278 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMS2P54278 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P54278 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMS2P54278 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms