Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ITGA8P53708 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 501.4 ms