Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOSBP53539 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOSBP53539 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOSBP53539 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOSBP53539 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOSBP53539 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOSBP53539 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOSBP53539 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOSBP53539 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOSBP53539 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOSBP53539 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOSBP53539 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOSBP53539 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOSBP53539 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOSBP53539 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOSBP53539 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOSBP53539 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOSBP53539 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOSBP53539 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOSBP53539 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOSBP53539 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOSBP53539 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOSBP53539 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOSBP53539 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOSBP53539 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOSBP53539 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOSBP53539 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOSBP53539 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOSBP53539 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOSBP53539 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOSBP53539 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOSBP53539 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOSBP53539 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOSBP53539 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOSBP53539 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOSBP53539 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOSBP53539 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOSBP53539 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms