Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC25A1P53007 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A1P53007 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms