Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
SMARCA2P51531 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SMARCA2P51531 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SMARCA2P51531 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms