Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCNN1BP51168 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms