Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB5CP51148 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB5CP51148 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms