Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERFP50548 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERFP50548 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERFP50548 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERFP50548 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERFP50548 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERFP50548 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERFP50548 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERFP50548 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERFP50548 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERFP50548 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERFP50548 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERFP50548 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERFP50548 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERFP50548 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERFP50548 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERFP50548 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERFP50548 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERFP50548 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERFP50548 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERFP50548 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERFP50548 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERFP50548 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERFP50548 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERFP50548 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERFP50548 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERFP50548 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERFP50548 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERFP50548 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERFP50548 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERFP50548 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERFP50548 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERFP50548 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERFP50548 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERFP50548 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERFP50548 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERFP50548 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERFP50548 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERFP50548 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERFP50548 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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