Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD2P49005 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD2P49005 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD2P49005 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD2P49005 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD2P49005 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD2P49005 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD2P49005 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD2P49005 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD2P49005 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD2P49005 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD2P49005 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD2P49005 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD2P49005 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD2P49005 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD2P49005 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD2P49005 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD2P49005 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD2P49005 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD2P49005 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD2P49005 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD2P49005 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLD2P49005 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD2P49005 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD2P49005 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD2P49005 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD2P49005 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD2P49005 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLD2P49005 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLD2P49005 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD2P49005 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD2P49005 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD2P49005 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD2P49005 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD2P49005 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD2P49005 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLD2P49005 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLD2P49005 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLD2P49005 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD2P49005 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD2P49005 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD2P49005 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLD2P49005 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms