Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms