Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMUP48645 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMUP48645 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NMUP48645 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NMUP48645 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NMUP48645 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMUP48645 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMUP48645 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMUP48645 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMUP48645 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMUP48645 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMUP48645 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMUP48645 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms