Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIP4K2AP48426 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms