Protein–RNA interactions for Protein: P46777

RPL5, 60S ribosomal protein L5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL5P46777 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL5P46777 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL5P46777 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL5P46777 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL5P46777 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL5P46777 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL5P46777 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL5P46777 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL5P46777 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL5P46777 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL5P46777 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL5P46777 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL5P46777 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL5P46777 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL5P46777 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL5P46777 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL5P46777 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL5P46777 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms