Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XCR1P46094 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCR1P46094 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCR1P46094 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XCR1P46094 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XCR1P46094 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCR1P46094 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XCR1P46094 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XCR1P46094 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms