Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR4A2P43354 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR4A2P43354 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms