Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSKP43235 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSKP43235 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSKP43235 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSKP43235 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSKP43235 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSKP43235 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSKP43235 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSKP43235 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSKP43235 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSKP43235 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSKP43235 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSKP43235 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSKP43235 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSKP43235 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSKP43235 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSKP43235 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSKP43235 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSKP43235 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSKP43235 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms